顺应潮流:仅血浆ctDNA-MRD检测的应用脆弱性!

2022-02-21 01:41:08 来源:
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"依赖连续性被划入MRD检查的潜力是明确的,希望这些进展将一直大幅提高这一代MRD检查的效率。"

年前列腺癌的MRD检查是一种灵活且特异的故常用风险评估年前列腺癌高血压肾脏中会源连续性遗传物质(如ctDNA)相比之下量的工具。在这种状态下,高血压没有看不见可见的软分组织,但或许共存规范针灸视觉工具无法检查到但之后会随之而来年前列腺癌患上的也就是说软分组织。

MRD,故常称之为也就是说湿气软分组织(Minimal Residual Disease)。用于“Minimal” (也就是说)这个含义,是因为它在文献和针灸专家中会愈来愈近似于。不过,“Minimal”这个含义或许具“误导连续性”,因为经故常性的病变在预后和立体化疗权衡方面也或许具关键连续性含义。“Measurable”(可测算)一含义可愈来愈确切地详细描述湿气在病人体内的癌细胞的共存。NCCN简介同时用于了“Minimal Residual Disease”(也就是说湿气软分组织)和“Measurable Residual Disease”(可测算湿气软分组织)两个名词。

此之外,可行连续性分析表明在底物高度上检查多种年前列腺癌种类的ctDNA都只具针灸效用,文献和针灸专家有时也会用于“Molecular Residual Disease”(底物湿气软分组织)一含义。

近几年来,国内之外在实质上中会基于ctDNA的MRD审核(ctDNA-MRD)的针灸信息和论据越来越多,开端了实质上瘤MRD检查的热潮。实质上瘤ctDNA-MRD检查的应用学派主要有两大类:

1)Tumor-informed assays(知情统计分析)

对原发其分组织透过测序以鉴定高血压的特异连续性状分组变异图说,然后内部设计引物独创panel或用于互换panel透过个连续性立体化的ctDNA检查统计分析。

2)Tumor-uninformed assays(发觉统计分析)

也可以称之为Tumor-agnostic assays或Tumor-naïve assays,即不用原发其分组织,均依赖于都由先敲定引物/探头内部设计的与年前列腺癌种类特别的互换panel透过ctDNA检查统计分析,;也检查ctDNA凋亡的同时,借助于ctDNA依赖连续性或视频分组学等多分组学工具。补救了其分组织样本缺乏或风险评估核糖体缺乏或TAT很短等缺陷。

Tumor-informed assays的应用作法愈来愈符合受众的认知,在保证高依赖连续性的年前提下,可通过风险评估多核糖体的sample-level(样本高度)有所大幅提高其清晰度,应用限额相比之下来说不是特别高。Tumor-uninformed assays的应用作法愈来愈近似于早筛,通过大幅提高site-level(核糖体高度)检查清晰度并借助于ctDNA依赖连续性或视频分组学并为基础机器学习算法有所大幅提高其清晰度和依赖连续性,应用限额相比之下来说极高。

2021年4月初29日,《Clinical Cancer Research》因特网发表了“均用于血清ctDNA检查常为肝癌高血压也就是说湿气软分组织(MRD)”的发表文章,首次披露了Guardant Reveal的分析信息:MRD检查清晰度约到91%,依赖连续性约100%,这些发现支持了均血清ctDNA-MRD检查(Tumor-uninformed assays)的潜在针灸应故常用。

2021年8月初13日,《Clinical Cancer Research》因特网发表了“顺应潮流:均血清ctDNA-MRD检查的应故常用年前景”的发表文章,在这里分析者们研讨审核了均血清ctDNA检查MRD的能力,以及将依赖连续性常为合到ctDNA检查的潜在效用。2

Parikh及其同僚1 和Taieb及其同僚3 研讨了均血清ctDNA-MRD检查在常为肝癌(CRC)高血压中会的潜在针灸应故常用。

▲ ctDNA依赖连续性和凋亡在两项分析中会的应故常用比较(Parikh和Taieb)

常为肝癌(CRC)的立体化疗基本上陷于着一个挑战,即相当多的CRC高血压因以年前营养不良患上而过早遇害。尽管针灸转用了规范的特别设计立体化疗,但替代性IIIC期CRC高血压的5年生存率也均有53%,而今是没有发现检查和上未曾检查到的也就是说湿气软分组织(MRD)。4

目年前,仍有鉴于确切确认哪些高血压术后共存MRD,以帮助督导降低或提高特别设计立体化疗,并提高治愈的或许连续性,同时最大限度地降低故意立体化疗的特别致癌。

在即使如此的几年里,我们对ctDNA在CRC诊断和预后中会的应故常用有了国际上的了解。目年前,基于ctDNA的MRD审核正国际上应故常用于年前列腺癌的立体化疗中会。

ctDNA是由DNA的短视频分组成(大约130-150bp),由癌细胞通过诱导、发炎或黏液释放到循环系统中会。 ctDNA的半衰期很短致使其成为尖锐的实时负荷遥相呼应,它的共存或许揭示了检查和上看不见的旋转移。

在治愈连续性立体化疗常为束后,ctDNA中会不止现的体细胞凋亡对随后的检查和患上具极高的不同之处连续性预测经济效益,特别是当这些凋亡与切除术的其分组织中会的凋亡近似于时。检查这种ctDNA概念的MRD可以在I-III期CRC中会提年前检查和数月初预测患上,从而为都由之后会患上的CRC高血压提供一个审核新疗法的窗口。然而,这些ctDNA基础凋亡概念的MRD检查工具的清晰度基本上是极少的,有鉴于简立体化其检查效率。

ctDNA的依赖连续性检查胜过ctDNA的基础凋亡检查。ctDNA的依赖连续性异;也CRC中会非故常故常见,并被视为大多数癌变的以年前阶段。这种依赖连续性,明确概念为DNA中会核苷酸的C5所在位置添加烷基基团,调节一处连续性状的表约,还包括经典的效癌连续性状失活。与基础凋亡相比之下于,CRC中会共存愈来愈多的依赖连续性反故常区域,为大幅提高MRD检查的清晰度提供了期望。SEPT9,就是第一个能用肾脏检查单连续性状依赖连续性反故常透过筛查和以年前检查CRC的工具。尽管ctDNA依赖连续性有这些优点,但这些相同的特连续性也需要果断,以保持检查统计分析的依赖连续性,并尽量降低实为不同之处连续性的或许连续性。

在这种取材下,Parikh和Taieb的总括最新分析常为果为我们对ctDNA效率的表达不止来提供了有用的必要,即不用原发其分组织,均通过肾脏ctDNA依赖连续性或联合ctDNA凋亡即可透过确切的MRD审核。与其他需要对原发其分组织透过测序以督导后续ctDNA统计分析的检查不同,总括分析探讨了Tumor-uninformed assays的有效连续性,它有几个占优势,还包括快速的TAT,大幅提高初始价格,对其分组织缺乏或必用的高血压透过风险评估。

Parikh等人提供了一种ctDNA依赖连续性为基础ctDNA基础凋亡的互换panel透过MRD的统计分析审核(NGS工具),与其他商业上可用的MRD检查工具相比之下于,这种工具不需要切除术的其分组织以及独创立体化。在之后立体化疗后用于时,这种均血清ctDNA-MRD检查对患上具针灸含义的依赖连续性(100%)和清晰度(55.6%),通过常为合表型连续性状分组不同之处和垂直风险评估统计分析,其清晰度可有所大幅提高至91%。1 该工具被故常用正试图透过的年前瞻连续性分析,还包括督导IIA期常为肠癌立体化疗权衡的NRG合作分组分析(NCT04068103)。虽然还需要额之外的信息集来验证这些发现,但这些常为果说明了基于ctDNA的MRD检查在发觉的情况下可接受的检查效率不同之处。

Taieb等人的分析能用了一对先年前被证明是CRC切除术后预后特别的依赖连续性连续性状标示不止物WIF1和NPY(ddPCR工具),并将它们应故常用于PRODIGE-GERCOR IDEA-France试验,将III期CRC高血压随机统称3个月初 vs 6个月初的特别设计立体化疗。在对参加III期试验的III期CRC高血压透过的首次ctDNA-MRD审核中会,有13.8%的高血压术后为ctDNA-MRD不同之处连续性,并被确认为独立的预后遥相呼应。3 同时,分析者也反驳,与其他转用NGS工具的ctDNA-MRD分析相比之下于,本分析中会ctDNA的不同之处连续性率较低。清晰度和PPV都只低于NGS检查常为果,ctDNA-MRD不同之处连续性和阴连续性的5年DFS分列65%和73%,尽管特别设计立体化疗的和不理想的年前统计分析样本妥善处理有或许对这些常为果产生影响。该工具比如说的是其相比之下简单,非故常低的价格和潜在的重演连续性,不需要商业检查中会所见的专利检查工具。正试图透过的年前瞻连续性分析将进一步审核均血清ctDNA检查否都能确切审核MRD,以便对CRC高血压透过风险低层,并督导特别设计立体化疗权衡。

无论转用何种工具,均用血清ctDNA-MRD检查来督导CRC高血压的立体化疗提议,需要合理且确切的检查工具。需有所大幅提高均血清ctDNA-MRD检查的清晰度来确认哪些高血压可以从立体化疗降入中会获益,以不致不恰当地选择高危高血压接受较低强度的立体化疗。Parikh及其同僚的分析常为果表明,常为合连续性状分组和表型连续性状分组以及垂直血清风险评估,可显著大幅提高均血清ctDNA-MRD的清晰度。相比之下于之下,ctDNA-MRD检查的高依赖连续性对于ctDNA作为一个完整的生物遥相呼应来确认立体化疗强立体化是至关关键连续性的。由于依赖连续性缺乏,实为不同之处连续性的ctDNA-MRD有或许使高血压接受故意的强立体化立体化疗。Parikh及其同僚的分析常为果证明,除基础凋亡之外,还可以通过为基础表型连续性状分组依赖连续性不同之处的统计分析来保持依赖连续性。Taieb等人的统计分析工具的占优势在于大幅提高了针灸不同之处的清晰度和预后,但是,正如分析者认定的那样,另行的两个连续性状依赖连续性标示不止或许无法提供与为基础基础凋亡工具的效率不同之处。关键连续性的是,这项工作也强调了规范统计分析年前必要条件的关键连续性连续性,因为各种提取工具可以在很大持续性上影响ctDNA的得率和完整连续性。在未曾来的分析中会,这些统计分析年前的回避将变得越来越关键连续性。

依赖连续性被划入MRD检查的潜力是明确的,希望这些进展将一直大幅提高这一代MRD检查的效率。总之,均血清ctDNA-MRD的检查提供了一个独特的期望,用于一种无创工具来探讨立体化疗方案,并有或许根除高危高血压的旋转移连续性软分组织。这些分析常为果无疑为未曾来ctDNA-MRD督导的年前瞻连续性针灸试验铺平了干道。

MRD,基本上是一个快速发展的各个领域,我们预计近两年有或许不止现新的论据,要么表明不止MRD检查的针灸效用的局限连续性,要么表明不止MRD检查的其他占优势和新用于。

简介:

1.Parikh Aparna R,Van Seventer Emily E,Siregna Giulia et al. Minimal Residual Disease Detection using a Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assay in Colorectal Cancer Patients.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

2.Bent A, Kopetz S. Going with the Flow: The Promise of Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assays. Clin Cancer Res. 2021 Oct 15;27(20):5449-5451.

3.Taieb Julien,Taly Valerie,Henriques Julie et al. Prognostic value and relation with adjuvant treatment duration of ctDNA in stage III colon cancer: a post-hoc ysis of the PRODIGE-GERCOR IDEA-France trial.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

4.Benson Al B,Venook Alan P,Cederquist Lynette et al. Colon Cancer, Version 1.2017, NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology.[J] .J Natl Compr Canc Netw, 2017, 15: 370-398.

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